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（從長沙臨大到西南聯大）

　　民國二十六年七月七日蘆溝橋事變，抗日戰爭爆發，未幾平津淪陷。八月，清華大學奉令與北京大學、南開大學在長沙合組「國立長沙臨時大學」，任命蔣夢麟、梅貽琦、張伯苓三校長為臨大校務委員會常務委員，共維校務。十月十日，臨大正式開課，校址設長沙小吳門外韭菜園聖經書院，理工學院在長沙對岸嶽麓山嶽麓書院上課，文學院在衡山上課。但是，戰況吃緊，容不下一張書桌。二十七年一月，上海戰事惡化，南京淪陷，政府遷都重慶，不得已只得再將臨大遷往雲南昆明。第一學期結束後，除器材書籍，已陸續分批運往昆明外。全校師生，分海陸兩途入滇：（一）海線：自長沙乘粵漢鐵路至廣州，以廣州珠江對岸之嶺南大學為招待站，然後分批自廣州乘船至香港，由港乘輪至安南之海防，再自海防乘滇越鐵路，分三日抵達昆明。（二）陸路：組織「湘黔滇旅行團」，由政府派陸軍中將黃師嶽擔任團長，率領師生三百餘人，於二月十九日自長沙出發。由長沙至益陽係搭船，再由益陽步行經過湘西抵達沅陵。由沅陵至晃縣係乘卡車，乘卡車是顧及當時湘西局勢不靖，為師生安全起見，有必要快速通過。嗣後穿越雲貴高原，直達昆明，完全步行。於四月廿八日平安抵達，沿途歷時六十八日。臨時大學遷滇之後，即奉令改名「國立西南聯合大學」。

　　西南聯大的領導體制和行政組織系統是沿襲長沙臨大原有的體系，並遵照國民政府在民國二十七年頒發的《大學組織法》之規定施行的。常務委員會為學校最高權力機構，以清華梅貽琦校長任常務委員會主席。三校校長中，北大校長蔣夢麟和南開校長張伯苓同時在重慶任職，所以較少來校，而清華校長梅貽琦常駐昆明，是實際掌理校務者。

　　民國二十七年五月一日聯大在昆明、蒙自兩地開課。文、法商兩學院在蒙自上課，理、工學院在昆明上課。理學院租借西門外昆華農業學校為校舍，工學院租借拓東路迤西會館、江西會館、全蜀會館，總辦事處設在城內崇仁街，同時在城西三分寺附近購地一百二十餘畝建築校舍。一學期後，文、法商學院遷回昆明，租借昆華工業學校為校舍。新設的師範學院（民國二十七年十二月十二日成立）租借昆華中學為校舍，總辦公室遷至才盛巷二號，繼而遷至昆華工業學校。民國二十八年春校舍落成，總辦公室及文、理、法商學院集中至新校舍。二十九年日軍侵入越南，重慶政府欲聯大遷往四川，而聯大只在四川敘永暫設分校。一年級新生及先修生在敘永上課，校本部仍留昆明不動。次年夏，局勢趨向穩定，敘永分校便告結束，學生六百餘人遷返昆明上課。

　　在教學條件上，遠較戰前清華為差。由於戰事影響，大部分儀器設備未能遷出，淪於敵手，遷出的部分貴重圖書亦在北碚毀於日機之轟炸。此一時期，不僅儀器設備差，圖書亦十分缺乏，學生閱讀的指定參考書或者沒有，或者只有很少幾本，學生要上圖書館排長隊擠借，形成“搶”風，館門屢次被擠破。因搶借參考書或過期不還而被記過的學生，占聯大受校紀處分的學生的大多數。這種現象在教育史上應是難得一見的吧！而清華研究院方面，在抗戰爆發後曾一度停辦。二十八年度開始恢復文科研究所。二十九年起，先後恢復法科研究所與理科研究所。除了文、法、理科研究所外，清華尚有特種研究所。特種研究所是清華利用庚款基金利息單獨舉辦的，包括農業、航空、無線電、金屬、國情普查五個研究所。農業研究所成立於民國二十三年，航空研究所於二十五年設於南昌。無線電、金屬研究所則於二十六年籌辦於長沙。抗戰後，農業、航空、無線電研究所也先後輾轉遷滇，並在昆明正式成立金屬研究所，又與社會部合作，成立國情普查研究所。除了航空研究所設於白龍潭外，其它四個研究所均設在大普吉。二十八年，政府宣布庚款暫行停付，清華之特種研究所仍設法在昆明繼續維持。三十二年五月，廢除不平等條約，庚子賠款止付，自此清華經費改由國庫撥給。特種研究所亦仍在昆明繼續工作。隨著抗戰勝利，清華復員北上，五個研究所相繼結束了它們的工作，其設備、人力等均分別併入有關各系。

　　民國三十四年八月，日本無條件投降，西南聯大暫時仍在昆明繼續課業。三校復員工作開始籌備。十一月，梅校長飛返北平，接收清華園校舍。日軍佔領下之清華園，因以校舍供作軍營，八年蹂躪，面目全非，需大事修繕得以復校。翌年，五月四日西南聯大結束，特在昆明立碑以紀念三校在抗戰八年中的艱苦合作。而聯大師範學院則改為國立昆明師範學院。三校分別復員，清華園修葺整理，頗費周章，於十月十日才恢復上課。